Cuenta la historia que en diciembre de 1633, en Nápoles, el padre Marcello Mastrilli estaba a punto de morir y San Francisco Javier se le apareció pidiéndole que renovara un voto que había hecho para trabajar en Japón y le dijo:

«Todos aquellos que imploren mi ayuda diariamente durante nueve días consecutivos, del 4 al 12 de marzo, y reciban dignamente los sacramentos de la Penitencia y la Sagrada Eucaristía en uno de los nueve días, experimentarán mi protección y podrán esperar con plena seguridad que obtendrán de Dios cualquier gracia que pidan para el bien de sus almas y la gloria de Dios». 

El Padre se levantó, instantáneamente curado. San Francisco Javier ha cumplido su promesa y esta devoción en su honor es conocida universalmente como la Novena milagrosa de la Gracia. 

La Novena de la Gracia comienza el 4 de marzo y finaliza el 12 de marzo día de la canonización de San Francisco Javier o se puede iniciar el 25 de noviembre y finalizar el 3 de diciembre día de su fiesta:

Novena de la Gracia:

Oh San Francisco Javier, muy amado y lleno de caridad, en unión contigo adoro con reverencia la Majestad de Dios y me regocijo con gran gozo en los singulares dones de gracia que te han sido otorgados durante tu vida, así como los dones de gloria después de la muerte y doy gracias a Dios de todo corazón; Te suplico con toda la devoción de mi corazón que te complazcas obtener para mí, por tu eficaz intercesión, sobre todas las cosas, la gracia de una vida santa y una muerte feliz. También, te ruego que me obtengas el siguiente favor (mencionar aquí el favor que se desea obtener). Pero si lo que te pido tan fervientemente no tiende a la gloria de Dios y al mayor bien de mi alma, te ruego que obtengas para mí lo que sea más provechoso para ambos fines. Amén.

Padre nuestro, Ave María, Gloria.